在本届东京奥运会上，截至8月6日，中国运动员共接受赛内外兴奋剂检查226例，未出现异常情况，实现了兴奋剂问题“零出现”；另外，代表团还尽最大努力实现“零感染”，确保参赛队伍健康，参赛期间未出现新冠肺炎病毒感染或被组委会确定为密接的情况。截至8月8日东京奥运会闭幕，代表团已回国692人，分别安排在北京、天津、辽宁、湖北等多地进行隔离。整体看来，东京奥运会中国体育代表团圆满完成了参赛任务，实现了参赛成绩和精神文明双丰收的目标，拿到了道德的金牌、风格的金牌、干净的金牌。
为实现兴奋剂问题“零出现”，代表团建立健全了覆盖参赛全过程的反兴奋剂工作机制。各个项目的中国队原则上从国内出发，在出发前对所有运动员实施兴奋剂检查。运动员抵达东京后，必须严格按照国际反兴奋剂机构、国际兴奋剂机构和东京奥组委的要求接受药检、就医和提交旅行信息。团队高度重视运动员饮食安全，避免误用和食源性兴奋剂。
另外，本届奥运会期间，疫情是各代表团参赛面临的最大的不确定性因素。奥运会期间，人流物流密集，奥运村居住密度高，中国代表团规模大、队伍多。海外疫情防控无经验可循，面临巨大风险和挑战。
为确保奥运征战的疫情防控安全，中国代表团团部专门设立疫情防控工作组，邀请防疫专家随团，在防疫物资准备、人员力量配备方面做充分准备，代表团成员疫苗接种率达到99.61%。抵达东京后，中国代表团立足于“做好自己”的防控原则，每日申报健康信息、唾液采样，除训练、比赛、吃饭、喝水、睡觉外，时刻佩戴口罩;实行每日疫情防控检查通报工作机制;要求运动员在颁奖仪式、接受采访期间佩戴口罩、做好自我防护。
东京奥运会后不久即举办十四届全运会，大部分的运动员、教练员回国后都要参加全运会。代表团加强前后方工作协同，统筹安排返程回国人员接受核酸检测，深入细致做好回国隔离疫情防控和隔离训练工作，在严防输入风险的前提下，最大程度保障奥运会参赛运动员和教练员顺利参加全运会。
